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離子色譜法測定環(huán)境空氣和廢氣中氯化氫時，樣品采集完畢，吸收液移入具塞比色管中定容后，即可直接在離子色譜儀上進樣分析。
用離子色譜法測定廢氣中硫酸霧時，當樣品中含有鈣、鍶、鎂、銅、鐵等金屬陽離子時可以通過陰離子樹脂柱交換處理的方法，除去干擾。
采用《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定固定污染源廢氣中氯化氫時，當廢氣中氯化氫濃度低時，吸收液濃度也可配得低一些，測定時稀釋至與淋洗液濃度相近。
采用《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）測定固定污染源廢氣中的硫酸霧時，采樣使用的濾筒對粒徑大于0.3μm的顆粒物阻隔效率不低于99.9%。
在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產(chǎn)生干擾。
《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）適用于環(huán)境空氣顆粒物（包括TSP、PM10、PM2.5、降塵等）中水溶性陰離子的測定，也適用于在特殊天氣下，采集的顆粒物（如沙塵氣溶膠和沙塵暴降塵）樣品的分析。
采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，降塵實驗室空白試樣是不稱取降塵樣品，按照與降塵試樣的制備相同步驟制備。
《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）的樣品運輸和保存規(guī)定，環(huán)境空氣顆粒物濾膜樣品在運輸和保存時應存放于濾膜盒中，避免折疊或擠壓；并在無刺激性氣體、避免陽光照射的環(huán)境條件下，置于4℃以下保存。
離子色譜的電導檢測器內(nèi)，電極間的距離G越小，死體積越小，則靈敏度越低。
《水質(zhì) 磷酸鹽的測定 離子色譜法》（HJ 669-2013）適用于地表水、地下水和降水中總磷酸鹽的測定。