生物信息學(xué)章節(jié)練習(xí)(2020.05.17)

來(lái)源：考試資料網(wǎng)

1.名詞解釋空位罰分

參考答案：空位罰分是為了補(bǔ)償插入和缺失對(duì)序列相似性的影響，序列中的空位的引入不代表真正的進(jìn)化事件，所以要對(duì)其進(jìn)行罰分，空位罰分的多...

2.填空題蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)搜索工具：（）

3.名詞解釋最大似然法（ML）

參考答案：它對(duì)每個(gè)可能的進(jìn)化位點(diǎn)分配一個(gè)概率，然后綜合所有位點(diǎn)，找到概率最大的進(jìn)化樹。最大似然法允許采用不同的進(jìn)化模型對(duì)變異進(jìn)行分...

4.問(wèn)答題MEGA2如何將其它多序列比對(duì)格式文件轉(zhuǎn)化為MEGE格式的多序列比對(duì)文件？

參考答案：（1）選擇菜單file，
（2）選擇Text File Editor and Format Coverter工...

5.問(wèn)答題在序列比對(duì)時(shí)DNA序列和蛋白質(zhì)序列得分矩陣的意義有何不同？

參考答案：核酸序列得分系統(tǒng)比較簡(jiǎn)單，只需要考慮匹配、不匹配及空位罰分這三種情況；而蛋白序列比對(duì)就要復(fù)雜得多，除了考慮匹配和空位罰分...

6.名詞解釋標(biāo)度樹

指分支長(zhǎng)度和相鄰節(jié)點(diǎn)對(duì)之間的差異成比例的系統(tǒng)發(fā)生樹。

7.名詞解釋極性鍵

在一個(gè)帶全正電的分子和另一個(gè)帶全負(fù)電的分子之間發(fā)生的相互作用。

8.問(wèn)答題簡(jiǎn)述構(gòu)建進(jìn)化樹的步驟，每一步列舉1-2種使用的軟件或統(tǒng)計(jì)學(xué)方法。

參考答案：（1）多序列比對(duì)：ClustalW
（2）校對(duì)比對(duì)結(jié)果：BIOEDIT
（3）建樹：MEGA ...

9.名詞解釋模塊替換矩陣（BLUSUM）

在替換矩陣中，每個(gè)位置的打分是在相關(guān)蛋白局部比對(duì)模塊中觀察到的替換的頻率而獲得的，每個(gè)矩陣被修改成一個(gè)特殊的進(jìn)化距離。

10.名詞解釋二級(jí)結(jié)構(gòu)

指源自蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的α螺旋、β折疊等局部結(jié)構(gòu)特征。